该命令集可以非常方便地向远程主机/服务器上传文件、运行远程脚本、下载文件等。

前言

两天研习Python基础系列文章为“learn by example”编程课程的python部分，原英文Github仓库点击此处，中文Github仓库点击此处，所有内容已发至简书（见章节部分）。

在博文怎么在hexo博客系统中用Rmarkdown写文章中我介绍了如何使用我创建的函数自动生成Rmarkdown文档并将其转换为markdown博文。文章并没有具体讲生成图片的过程，我在前一篇文章怎么对连续变量分组并进行生存分析写作时发现用hexo系统存在一些小问题：hexo生成public静态网页文档集合（包括主页展示的所有内容）和博文所在的source文件夹是相对独立的，这会导致markdown的图片引用路径时在本地用一些markdown预览器可以看到图片，但实际呢，在部署的博客上却看不到了！

在我之前转载的文章apply,lapply,sapply用法探索中已经对R中apply家族函数进行了比较详细地说明，这篇文章基于我在data campus中对lapply、sapply、vapply几个函数的学习，以更为简单的实例来了解这几个以列表对输入的迭代函数。

在探究基因表达、基因拷贝数等连续变量对癌症病人的预后情况的影响时，我不得不面对和处理的主要问题是如何对这种连续型的变量进行分组，然后进行相应的生存分析。

作为一个搞数据分析的，动笔总少不了图和代码，markdown对代码本身就有不错的区分和高亮支持，但你永远不可能用markdown写出图来啊！这类东东人们称之为静态的。为了解决这类问题，现在有两个非常流行的动态文档工具，一是Python中的Jupyter Notebook,另外就是Rstudio公司开发的 Rmarkdown了。

有人在微信群里问到这样一个问题：

请问我想把参考基因组中所有的A和C替换成C和A，小写也按照这样的规则替换，该怎么实现呢，tr可以做到，但是我想保证>后面的染色体名字不会被替换?

学习内容：

• 学习sed编辑器
• gawk编辑器入门
• sed编辑器基础

shell脚本最常见的一个用途就是处理文本文件，但仅靠shell脚本命令来处理文本文件的内容有点勉为其难。如果我们想在shell脚本中处理任何类型的数据，需要熟悉Linux中的sed和gawk工具。这两个工具可以极大简化我们需要进行的数据处理任务。

纯属搬砖操作，资料来源《Github入门与实战》，这本书的重要信息也就这些了，需要的时候找一找。

书上提到的一个学习网站https://learngitbranching.js.org/非常棒，线上学习。

来源： Linux命令行与shell脚本编程大全

内容：

• 创建文本菜单
• 创建文本窗口部件
• 添加X Window图形

创建文本菜单

创建交互式shell脚本最常用的方法是使用菜单，它提供了各种选项帮助脚本用户了解脚本能做到的和不能做的。

shell脚本菜单的核心是case命令，该命令会根据用户在菜单上的选择来执行特定命令。

下面我们逐步了解和创建基于菜单的shell脚本的步骤。